Unveiled electric profiles within hydrogen bonds suggest DNA base pairs with similar bond strengths
Ruiz Blanco, Yasser B. (Universidad Central Marta Abreu de Las Villas)
Almeida, Y. (University of Hamburg)
Sotomayor Torres, Clivia M. (Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia)
García, Yamila (Universitat Politècnica de Catalunya)

Data:	2017
Resum:	Electrical forces are the background of all the interactions occurring in biochemical systems. From here and by using a combination of ab-initio and ad-hoc models, we introduce the first description of electric field profiles with intrabond resolution to support a characterization of single bond forces attending to its electrical origin. This fundamental issue has eluded a physical description so far. Our method is applied to describe hydrogen bonds (HB) in DNA base pairs. Numerical results reveal that base pairs in DNA could be equivalent considering HB strength contributions, which challenges previous interpretations of thermodynamic properties of DNA based on the assumption that Adenine/Thymine pairs are weaker than Guanine/Cytosine pairs due to the sole difference in the number of HB. Thus, our methodology provides solid foundations to support the development of extended models intended to go deeper into the molecular mechanisms of DNA functioning.
Ajuts:	Ministerio de Economía y Competitividad FIS2015-70862P Ministerio de Economía y Competitividad SEV-2013-0295
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Base Pairing ; DNA ; Hydrogen Bonding ; Nucleic Acid Conformation
Publicat a:	PloS one, Vol. 12, Núm. 10 (October 2017) , art. e0185638, ISSN 1932-6203

DOI: 10.1371/journal.pone.0185638
PMID: 28982182

11 p, 2.7 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències > Institut Català de Nanociència i Nanotecnologia (ICN2)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats