Extreme differences between human germline and tumor mutation densities are driven by ancestral human-specific deviations
Heredia-Genestar, José María (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona))
Marques-Bonet, Tomas 1975- (Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont)
Juan, David (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona))
Navarro, Arcadi, 1969- (Institut de Biologia Evolutiva (UPF-CSIC) (Barcelona))

Data:	2020
Resum:	Mutations do not accumulate uniformly across the genome. Human germline and tumor mutation density correlate poorly, and each is associated with different genomic features. Here, we use non-human great ape (NHGA) germlines to determine human germline- and tumor-specific deviations from an ancestral-like great ape genome-wide mutational landscape. Strikingly, we find that the distribution of mutation densities in tumors presents a stronger correlation with NHGA than with human germlines. This effect is driven by human-specific differences in the distribution of mutations at non-CpG sites. We propose that ancestral human demographic events, together with the human-specific mutation slowdown, disrupted the human genome-wide distribution of mutation densities. Tumors partially recover this distribution by accumulating preneoplastic-like somatic mutations. Our results highlight the potential utility of using NHGA population data, rather than human controls, to establish the expected mutational background of healthy somatic cells.
Ajuts:	Ministerio de Economía y Competitividad BFU2017-86471-P Ministerio de Economía y Competitividad BFU2015-68649-P Ministerio de Ciencia e Innovación FJCI-2016-29558 Agencia Estatal de Investigación PGC2018-101927-BI00 Instituto de Salud Carlos III PT17-0009-0020 Ministerio de Ciencia e Innovación CEXS2028-000792-M Agència de Gestió d'Ajuts Universitaris i de Recerca 2017-SGR-880
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Cancer ; Evolutionary genetics ; Mutation
Publicat a:	Nature communications, Vol. 11 (May 2020) , art. 2512, ISSN 2041-1723

DOI: 10.1038/s41467-020-16296-4
PMID: 32427823

9 p, 2.2 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències > Institut Català de Paleontologia Miquel Crusafont (ICP)
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats