Computational methods to predict protein aggregation
Navarro, Susanna (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Ventura, Salvador (Universitat Autònoma de Barcelona. Institut de Biotecnologia i de Biomedicina "Vicent Villar Palasí")
Data: |
2022 |
Resum: |
In most cases, protein aggregation stems from the establishment of non-native intermolecular contacts. The formation of insoluble protein aggregates is associated with many human diseases and is a major bottleneck for the industrial production of protein-based therapeutics. Strikingly, fibrillar aggregates are naturally exploited for structural scaffolding or to generate molecular switches and can be artificially engineered to build up multi-functional nanomaterials. Thus, there is a high interest in rationalizing and forecasting protein aggregation. Here, we review the available computational toolbox to predict protein aggregation propensities, identify sequential or structural aggregation-prone regions, evaluate the impact of mutations on aggregation or recognize prion-like domains. We discuss the strengths and limitations of these algorithms and how they can evolve in the next future. |
Ajuts: |
European Commission PhasAge/H2020-WIDESPREAD-2020-5 Ministerio de Ciencia e Innovación PID2019-105017RB-I00
|
Nota: |
Altres ajuts: acords transformatius de la UAB |
Drets: |
Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades. |
Llengua: |
Anglès |
Document: |
Article ; recerca ; Versió publicada |
Publicat a: |
Current Opinion in Structural Biology, Vol. 73 (april 2022) , p. 102343, ISSN 1879-033X |
DOI: 10.1016/j.sbi.2022.102343
PMID: 35240456
El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca >
Documents dels grups de recerca de la UAB >
Centres i grups de recerca (producció científica) >
Ciències de la salut i biociències >
Institut de Biotecnologia i de Biomedicina (IBB) Articles >
Articles de recercaArticles >
Articles publicats
Registre creat el 2022-03-15, darrera modificació el 2023-06-21