Selective cleavage of ncRNA and antiviral activity by RNase2/EDN in THP1-induced macrophages
Lu, Lu (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Li, Jiarui (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Wei, RanLei (Sichuan University. National Frontier Center of Disease Molecular Network)
Guidi, Irene (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Cozzuto, Luca (Centre de Regulació Genòmica)
Ponomarenko, Julia (Centre de Regulació Genòmica)
Prats-Ejarque, Guillem (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Boix i Borràs, Esther (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)

Data:	2022
Resum:	RNase2 is the member of the RNaseA family most abundant in macrophages. Here, we knocked out RNase2 in THP-1 cells and analysed the response to Respiratory Syncytial Virus (RSV). RSV induced RNase2 expression, which significantly enhanced cell survival. Next, by cP-RNAseq sequencing, which amplifies the cyclic-phosphate endonuclease products, we analysed the ncRNA population. Among the ncRNAs accumulated in WT vs KO cells, we found mostly tRNA-derived fragments (tRFs) and second miRNAs. Differential sequence coverage identified tRFs from only few parental tRNAs, revealing a predominant cleavage at anticodon and D-loops at U/C (B1) and A (B2) sites. Selective tRNA cleavage was confirmed in vitro using the recombinant protein. Likewise, only few miRNAs were significantly more abundant in WT vs RNase2-KO cells. Complementarily, by screening of a tRF & tiRNA array, we identified an enriched population associated to RNase2 expression and RSV exposure. The results confirm the protein antiviral action and provide the first evidence of its cleavage selectivity on ncRNAs.
Ajuts:	Fundació la Marató de TV3 2080310 Ministerio de Economía y Competitividad SAF2015-66007P Agencia Estatal de Investigación PID2019-106123GB-I00
Nota:	Altres ajuts: acords transformatius de la UAB
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	RNase ; Virus ; RSV ; Mirna ; Trna ; Trf
Publicat a:	Cellular and Molecular Life Sciences, Vol. 79, Issue 4 (April 2022) , art. 209, ISSN 1420-9071

DOI: 10.1007/s00018-022-04229-x
PMID: 35347428

18 p, 1.8 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats