Next-Generation Sequencing for Confronting Virus Pandemics
Quer, Josep 1963- (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Colomer-Castell, Sergi (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Campos, Carolina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Andrés, Cristina (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Piñana, Maria (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Cortese, Maria Francesca (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
González-Sánchez, Alejandra (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Garcia-Cehic, D. (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Ibáñez, Marta (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Pumarola Suñé, Tomàs (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Rodríguez Frías, Francisco (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Bioquímica i de Biologia Molecular)
Antón, Andrés (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Genètica i de Microbiologia)
Tabernero, David (Hospital Universitari Vall d'Hebron)

Data:	2022
Resum:	Virus pandemics have happened, are happening and will happen again. In recent decades, the rate of zoonotic viral spillover into humans has accelerated, mirroring the expansion of our global footprint and travel network, including the expansion of viral vectors and the destruction of natural spaces, bringing humans closer to wild animals. Once viral cross-species transmission to humans occurs, transmission cannot be stopped by cement walls but by developing barriers based on knowledge that can prevent or reduce the effects of any pandemic. Controlling a local transmission affecting few individuals is more efficient that confronting a community outbreak in which infections cannot be traced. Genetic detection, identification, and characterization of infectious agents using next-generation sequencing (NGS) has been proven to be a powerful tool allowing for the development of fast PCR-based molecular assays, the rapid development of vaccines based on mRNA and DNA, the identification of outbreaks, transmission dynamics and spill-over events, the detection of new variants and treatment of vaccine resistance mutations, the development of direct-acting antiviral drugs, the discovery of relevant minority variants to improve knowledge of the viral life cycle, strengths and weaknesses, the potential for becoming dominant to take appropriate preventive measures, and the discovery of new routes of viral transmission.
Ajuts:	Ministerio de Economía y Competitividad RD16/0016/0003 Ministerio de Economía y Competitividad DI-20200297 Ministerio de Economía y Competitividad GLD21_0000 Ministerio de Economía y Competitividad PI19/00301
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	NGS ; Deep-sequencing ; Viruses ; SARS-CoV-2 ; COVID-19 ; Variability ; Zoonosis ; Pandemics ; Diagnostic tools
Publicat a:	Viruses, Vol. 14 (march 2022) , ISSN 1999-4915

DOI: 10.3390/v14030600
PMID: 35337007

23 p, 2.1 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats