The transcribed ultraconserved region uc.160+ enhances processing and A-to-I editing of the miR-376 cluster : hypermethylation improves glioma prognosis
Soler, Marta (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Davalos, Veronica (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Sánchez Castillo, Anaís (Maastricht University Medical Center)
Mora Martínez, Carlos (University of Helsinki)
Setién, Fernando (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Siqueira, E (Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnológico)
Castro de Moura, Manuel (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Esteller, M (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)
Guil, Sonia (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras)

Data:	2022
Resum:	Transcribed ultraconserved regions (T-UCRs) are noncoding RNAs derived from DNA sequences that are entirely conserved across species. Their expression is altered in many tumor types, and, although a role for T-UCRs as regulators of gene expression has been proposed, their functions remain largely unknown. Herein, we describe the epigenetic silencing of the uc. 160+ T-UCR in gliomas and mechanistically define a novel RNA-RNA regulatory network in which uc. 160+ modulates the biogenesis of several members of the miR-376 cluster. This includes the positive regulation of primary microRNA (pri-miRNA) cleavage and an enhanced A-to-I editing on its mature sequence. As a consequence, the expression of uc. 160+ affects the downstream, miR-376-regulated genes, including the transcriptional coregulators RING1 and YY1-binding protein (RYBP) and forkhead box P2 (FOXP2). Finally, we elucidate the clinical impact of our findings, showing that hypermethylation of the uc. 160+ CpG island is an independent prognostic factor associated with better overall survival in lower-grade gliomas, highlighting the importance of T-UCRs in cancer pathophysiology.
Ajuts:	Agencia Estatal de Investigación PID2019-111658RB-I00 Agencia Estatal de Investigación RTI2018-094049-B-I00
Nota:	Altres ajuts:We thank the CERCA program (Generalitat de Catalunya) and the Josep Carreras Foundation for institutional support. This work was supported by the Ministerio de Ciencia e Innovación (MCI)-Agencia Estatal de Investigación (AEI) and the Instituto de Salud Carlos III (ISCIII), cofinanced by the European Development Regional Fund, 'A way to achieve Europe' ERDF, under grant numbers PID2019-111658RB-I00 (SG), RTI2018-094049-B-I00 'EPIRNA' (ME), and the Health and Science Departments of the Catalan Government (Generalitat de Catalunya).
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Matèria:	Conserved Sequence ; CpG Islands ; DNA Methylation ; Gene Expression Regulation, Neoplastic ; Glioma ; Humans ; MicroRNAs ; A-to-I editing ; Mir-376 ; Noncodingrna ; Pri-mirna biogenesis ; T-UCR
Publicat a:	Molecular Oncology, Vol. 16 Núm. 3 (february 2022) , p. 648-664, ISSN 1878-0261

DOI: 10.1002/1878-0261.13121
PMID: 34665919

17 p, 1.3 MB

El registre apareix a les col·leccions:
Documents de recerca > Documents dels grups de recerca de la UAB > Centres i grups de recerca (producció científica) > Ciències de la salut i biociències > Institut d'Investigació en Ciencies de la Salut Germans Trias i Pujol (IGTP) > Institut de Recerca contra la Leucèmia Josep Carreras
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats