Schlafen 12 restricts HIV-1 latency reversal by a codon-usage dependent post-transcriptional block in CD4+ T cells
Kobayashi-Ishihara, Mie (Keio University School of Medicine)
Frazão Smutná, Katarína (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Alonso, Florencia E. (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Argilaguet, Jordi 1977- (Unitat mixta d'investigació IRTA-UAB en Sanitat Animal. Centre de Recerca en Sanitat Animal)
Esteve-Codina, Anna (Centre de Regulació Genòmica)
Geiger, Kerstin (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Genescà Ferrer, Meritxell (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Grau Expósito, Judith (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Duran-Castells, Clara (Institut Germans Trias i Pujol. Institut de Recerca de la Sida IrsiCaixa)
Rogenmoser, Selina (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Böttcher, René (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Jungfleisch, Jennifer (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Oliva Miguel, Baldomero (Universitat Pompeu Fabra. Structural Bioinformatics Group)
Martinez, Javier P. (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Li, Manqing (University of California San Diego. Section of Molecular Biology)
David, Michael (University of California San Diego. Moores Cancer Center)
Yamagishi, Makoto (The University of Tokyo. Graduate School of Frontier Sciences)
Ruiz Riol, Marta (CIBER de Enfermedades Infecciosas)
Brander, Christian (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)
Tsunetsugu-Yokota, Yasuko (Tokyo University of Technology. Department of Medical Technology)
Buzón, Maria José (Hospital Universitari Vall d'Hebron. Institut de Recerca)
Díez, Juana (Universitat Pompeu Fabra. Departament de Medicina i Ciències de la Vida)
Meyerhans, Andreas (Institució Catalana de Recerca i Estudis Avançats)

Date:	2023
Abstract:	Latency is a major barrier towards virus elimination in HIV-1-infected individuals. Yet, the mechanisms that contribute to the maintenance of HIV-1 latency are incompletely understood. Here we describe the Schlafen 12 protein (SLFN12) as an HIV-1 restriction factor that establishes a post-transcriptional block in HIV-1-infected cells and thereby inhibits HIV-1 replication and virus reactivation from latently infected cells. The inhibitory activity is dependent on the HIV-1 codon usage and on the SLFN12 RNase active sites. Within HIV-1-infected individuals, SLFN12 expression in PBMCs correlated with HIV-1 plasma viral loads and proviral loads suggesting a link with the general activation of the immune system. Using an RNA FISH-Flow HIV-1 reactivation assay, we demonstrate that SLFN12 expression is enriched in infected cells positive for HIV-1 transcripts but negative for HIV-1 proteins. Thus, codon-usage dependent translation inhibition of HIV-1 proteins participates in HIV-1 latency and can restrict the amount of virus release after latency reversal. In cell lines and HIV-1 patient PBMCs, the Schlafen 12 protein (SLFN12) is shown to be an HIV-1 restriction factor that inhibits HIV-1 replication and virus reactivation.
Grants:	Agencia Estatal de Investigación PID2019-106323RB-I00
Rights:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Language:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Subject:	Restriction factors ; HIV infections
Published in:	Communications Biology, Vol. 6 (may 2023) , ISSN 2399-3642

DOI: 10.1038/s42003-023-04841-y
PMID: 37165099

15 p, 3.5 MB

The record appears in these collections:
Research literature > UAB research groups literature > Research Centres and Groups (research output) > Health sciences and biosciences > Centre de Recerca en Sanitat Animal (CReSA-IRTA)
Articles > Research articles
Articles > Published articles