The Comparative Analysis of Two RT-qPCR Kits for Detecting SARS-CoV-2 Reveals a Higher Risk of False-Negative Diagnosis in Samples with High Quantification Cycles for Viral and Internal Genes
Luraschi, Roberto (Universidad de Santiago de Chile)
Barrera-Avalos, Carlos (Universidad de Santiago de Chile)
Vallejos Vidal, Eva Carolina (Universidad de Las Américas)
Alarcón, Javiera (Universidad de Santiago de Chile)
Mella-Torres, Andrea (Universidad de Santiago de Chile)
Hernández Vargas, Felipe (Universidad de Santiago de Chile)
Inostroza-Molina, Ailen (Universidad de Santiago de Chile)
Valdés, Daniel (Universidad de Santiago de Chile)
Imarai, Mónica (Universidad de Santiago de Chile)
Acuña-Castillo, Claudio (Universidad de Santiago de Chile)
Reyes-López, Felipe E. (Universitat Autònoma de Barcelona. Departament de Biologia Cel·lular, de Fisiologia i d'Immunologia)
Sandino, Ana María (Universidad de Santiago de Chile)

Data:	2022
Resum:	The early detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) using the real-time quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR) as a gold-standard molecular tool has allowed to test and trace the viral spread and the isolation of COVID-19-infected patients. The detection capacity of viral and internal genes is an essential parameter to consider and analyze during the assay. In this study, we analyze the performance of the two commercial RT-qPCR kits used in Chile, TaqMan™ 2019-nCoV Control Kit v1 (Thermo Fisher) and MaxCov19 (TAAG Genetics), for the COVID-19 diagnosis from nasopharyngeal swab samples (NPSs). Our results show a lower sensitivity of the TAAG kit compared to the Thermo Fisher kit, even in the detection of SARS-CoV-2 mutations associated with its variants. This study reinforces the relevance of evaluating the performance of RT-qPCR kits before being used massively since those with lower sensitivity can generate false negatives and produce outbreaks of local infections.
Drets:	Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, la comunicació pública de l'obra i la creació d'obres derivades, fins i tot amb finalitats comercials, sempre i quan es reconegui l'autoria de l'obra original.
Llengua:	Anglès
Document:	Article ; recerca ; Versió publicada
Publicat a:	The Canadian Journal of Infectious Diseases & Medical Microbiology = Journal Canadien des Maladies Infectieuses et de la Microbiologie Médicale, Vol. 2022 (july 2022) , ISSN 1918-1493

DOI: 10.1155/2022/2594564
PMID: 35812012

10 p, 539.4 KB

El registre apareix a les col·leccions:
Articles > Articles de recerca
Articles > Articles publicats