| Publicación: |
Centre de Recerca Matemàtica 2007 |
| Descripción: |
18 p. |
| Resumen: |
We present experimental and theoretical analyses of data requirements for haplotype inference algorithms. Our experiments include a broad range of problem sizes under two standard models of tree distribution and were designed to yield statistically robust results despite the size of the sample space. Our results validate Gusfield's conjecture that a population size of n log n is required to give (with high probability) sufficient information to deduce the n haplotypes and their complete evolutionary history. The experimental results inspired our experimental finding with theoretical bounds on the population size. We also analyze the population size required to deduce some fixed fraction of the evolutionary history of a set of n haplotypes and establish linear bounds on the required sample size. These linear bounds are also shown theoretically. |
| Derechos: |
Aquest document està subjecte a una llicència d'ús Creative Commons. Es permet la reproducció total o parcial, la distribució, i la comunicació pública de l'obra, sempre que no sigui amb finalitats comercials, i sempre que es reconegui l'autoria de l'obra original. No es permet la creació d'obres derivades.  |
| Lengua: |
Anglès |
| Colección: |
Centre de Recerca Matemàtica. Prepublicacions |
| Colección: |
Prepublicacions del Centre de Recerca Matemàtica ; 757 |
| Documento: |
Article ; Prepublicació ; Versió de l'autor |
| Materia: |
Gens ;
Mapatge ;
Filogènia ;
Processament de dades ;
Inferència |
visitante ::
identificación
